בשונה מהעיסוי השוודי קלאסי, עיסוי רקמות עמוק עושה שימוש בטכניקות מגע אגרסיביות יותר, ומטרותיו לעודד האצת תהליכי תיקון הרקמות של הגוף. 

בשיטת עיסוי זו מופעל לחץ רב יותר - וזאת על מנת לעבור את רקמות החיבור (גידים, שומן, עור ורצועות) ולחדור ללב ליבה של רקמת השריר. החדירה העמוקה והממוקדת לתוך השריר גורמת לזעזוע מסויים בו, אשר הגוף מתייחס אליו כאל פציעה קלה, ולכן יחל בתהליך הריפוי הטבעי ויזרים למקום המטופל כמות גדולה של חומרי בניין

לתיקון ושחזור הרקמה. אנו למעשה מבצעים פציעה מדומה ונשלטת.

כגירוי לטיפול הגוף יעודד את הרקמה להפריש החוצה חומרי פסולת ולוואי אשר הצטברו בה, ובכך יאפשר הקלה בתחושת הנוקשות והגודש בשריר.

העיסוי מבוצע על מיטת טיפולים עם מעט שמן, בתנועות לאורכם ורוחבם של סיבי השריר, לחיצות ממוקדות, וויברציות קלות ו"לישת" תאי השריר.

לאחר הטיפול ייתכן ויורגש כאב עמום והרגשת נוקשות עד 48 שעות מתום העיסוי, וזאת בעקבות תגובתו של הגוף ותחילת שיקום הרקמות. חשוב להקפיד על שתיה מרובה על מנת "לשטוף" את חומרי הפסולת שהופרשו מתוך התאים.

עיסוי רקמות עמוק מומלץ כחלק מסדרת עיסויים טיפוליים ולא רק כטיפול בודד, וזאת על מנת לרכז את תהליכי הבנייה והתיקון של הרקמות במקום אחד, או בקבוצת איברים, בכל טיפול.